Découverte de deux anomalies génétiques dominantes en race Holstein grâce à l'analyse des taux de mortalité par familles de pères

Contact : Aurélien Capitan
Référence : Besnard F., Boussaha M., Leclerc H., Grohs C., Jewell N. Pinton A. Barsac H., Jourdain J., Femenia M., Dorso L., Strugnell B., Floyd T., Danchin-Burge C., Guatteo R., Cassart D., Hubin X., Mattalia S., Boichard D., Capitan A. 2022. Detailed analysis of mortality rates in the female progeny of 1001 Holstein bulls allows the discovery of new dominant genetic defects. J Dairy Sci, 106, https://doi.org/10.3168/jds.2022-22365

L‘origine d’une forme de palais fendu chez les bovins Limousins élucidée : implication du gène MYH3

Contact : Amandine Duchesne
Référence : Vaiman A., Fritz S., Beauvallet C., Boussaha M., Grohs C., Daniel‑Carlier N., Relun A., Boichard D., Vilotte J.L.,  Duchesne A. 2022. Mutation of the MYH3 gene causes recessive cleft palate in Limousine cattle. Genetics Selection Evolution, 54:71. https://doi.org/10.1186/s12711-022-00762-2

Genetics Selection Evolution : revue Open Access en progression

Contact : Helene Hayes et Didier Boichard

Référence : https://gsejournal.biomedcentral.com/

Intégration d’annotations complexes dans des modèles de prédiction génomique bayésiens

Contact : Andrea Rau et Pascal Croiseau 
Références :
•    Mollandin, F., Gilbert, H., Croiseau, P., Rau, A. (2022) Accounting for overlapping annotations in genomic prediction models of complex traits. BMC Bioinformatics, 23:65. 
•    Mollandin, F. (2022) Intégration d’annotations fonctionnelles dans des modèles de prédiction génomique bayésiens. Thèse de doctorat en mathématiques appliquées, Université de Paris Saclay.
•    Logiciel BayesRCO: https://github.com/fmollandin/BayesRCO

Des index génétiques pour la sélection des propriétés fromagères du lait

Contact : Marie-Pierre Sanchez 

Référence : Sanchez MP, Tribout T, Fritz S, Wolf V, Laithier C, Brochard M, Boichard D. 2022. Opportunities for genomic selection of cheese-making traits in Montbéliarde cows. J. Dairy Sci. 105, 5206-5220. https://doi.org/10.3168/jds.2021-21558

Vers une amélioration de la résistance à la paratuberculose bovine grâce à une évaluation génomique Single-Step

Contact : Marie-Pierre Sanchez 

Référence : Sanchez M.-P., Tribout T., Fritz S., Guatteo R., Fourichon C., Schibler L., Delafosse A., Boichard D. New insights into genetic resistance to paratuberculosis in Holstein via a single-step genomic evaluation. 2022. Genet. Sel. Evol. 54:67. https://doi.org/10.1186/s12711-022-00757-z 

Publication des index bovins laitiers estimés par la méthode « Single Step »  

Contact : Thierry Tribout, Didier Boichard

Etude de la tolérance à la chaleur et interactions entre génétique x température chez les bovins

Contact : Aurélie Vinet

Référence : Vinet A., Mattalia S., Vallée R., Bertrand C., Persyn B., Cuyabano B.C.D., Boichard D. Estimation of genotype by temperature-humidity index interactions on milk production and udder health traits in the Montbeliarde cows. Genet Sel Evol,