Liste des doctorants et thèses en cours

Thèses en cours

Liste des doctorants et thèses en cours

BERNARD Maria (05/2021-05/2024): "Étude du rôle fonctionnel du microbiote intestinal dans l’adaptation au stress abiotique et dans l’efficience alimentaire de la poule pondeuse en utilisant une approche multi-omique." Equipe GiBBS. Encadrants : T. Zerjal (GiBBS), F. Calenge (GeMS), G. Pascal (INRAE Toulouse)

BESNARD Florian (06/2021-06/2024) : "L'étude sur la mortalité des jeunes bovins au sein des filières bovines, en particulier en bovins laitiers." Equipe G2B. Encadrants : S. Mattalia, D. Boichard, A. Capitan

BRULIN Louise (02/2022-01/2025) : "Apport des données microbiote chez les bovins sur la prediction de traits chez l’hôte." Encadrants : J. Estellé-Fabrellas (GeMS), P. Croiseau (G2B)

DIMITROVA Simone  (06/2021-05/2025) :  "Kin selection and genetic Improvement of the Black Soldier Fly (Hermetia Illucens)." Encadrante : Florence Phocas (GenAqua)

DUFOUR Adrien (02/2021-01/2024) : "Prédiction des états de pluripotence cellulaire par des données multi-omics unicellulaire et son application pour le phénotypage ex vivo de caractères de santé." Equipe GaLaC, Encadrant : H. Acloque

FOUERE Corentin (11/2022-10/2025) : "Caractérisation des effets épigénétiques transgénérationnels chez le bovins et de leur composante génétique (Projet GenEpi)." Equipe G2B, Encadrants : M. BOUSSAHA et C.HOZE

FRESCO Solène (04/2022-03/2025) : "Analyse génétique des émissions de méthane des vaches laitières : amélioration de la connaissance et proposition de mise en place d’une évaluation." Equipe G2B, Encadrants : D. Boichard, P. Martin

JANSSEUNE Samuel (09/2021-08/2025) : "Postbiotique issu de deux souches de Lactobacilles dans l’aliment du poulet de chair :  composition et effets sur les performances, l’immunité et la santé." Equipe GeMS, Encadrants : M-H. Pinard-van der Laan, F. Calenge 

JOURDAIN Jeanlin (07/2021-07/2024) : "Identification et caractérisation de mutations affectant fertilité mâle, fertilité femelle et durée de gestation chez le bovin en exploitant des bases de données populationnelles." Equipe G2B, Encadrants : D. Boichard, A. Capitan

KISTLER Tristan (01/2022-12/2024) : "Multitrait selection breeding plans for honey bees (Apis Mellifera) : design and efficiency." Equipe GenAqua, Encadrante: F. Phocas

KO Jeong Hwan (10/2023 – 09/2026) : "Intégration de données multi-omiques appariées à grande échelle." MIAT/équipe GiBBS. Encadrants: A. Rau, N. Vialaneix (INRAE MIAT)

LECOEUR Alexandre (12/2020-04/2024) : "Effet combiné de la génétique et du microbiote intestinal sur la réponse vaccinale et le bien-être chez la poule." Equipe GeMS. Encadrant M.H. Pinard-Van der Laan, F. Calenge

PETY Solène (11/2023-10/2026) "Méthodes hologénomiques pour prendre en compte le microbiote de l’hôte dans les évaluations génétiques"  Equipe GiBBS/MaIAGE. Encadrants :  A. Rau, M. Mariadassou (MaIAGE), I. David (GenPhySE)

RACANATI Alice  (12/2023-11/2026) : "Déterminisme génétique de la réponse vaccinale et de la compostion du microbiote caecal chez la poule en élevage plein-air." Encadrantes : F. Calenge/M.H. Pinard Van deer Lan (GeMS)  

SHOKOR Fatima (10/2022-09/2025) : "Utilisation d'algorithmes d'apprentissage profond pour la prédiction génomique et l'appui aux objectifs de sélection." Equipe G2B. Encadrants : B.CASTRO DIAS/P.CROISEAU

SIMON Marie (01/2023-12/2025) : "La communication par les vésicules extracellulaires mammaires : de leur fonction biologique à leur rôle de vecteur de polluants de type nanoparticules métalliques." Equipe GaLaC. Encadrante : A. BURTEY

SORIN Valentin (11/2023-10/2026) : "Décrypter les variations phénotypiques des trois espèces de ruminants et comprendre leur évolution à l’aide de pangénomes." Equipe G2B/GenPhySE. Encadrants : M. Boussaha, G.Tosser-Klopp 

THOMAS Valentin (09/2023-08/2026) : "Déterminisme génétique et mécanismes de résistance aux maladies chez la truite arc-en-ciel." Equipe GenAqua. Encadrants : D. Lallias, F. Phocas

TOMILINA Ekaterina (10/2022-09/2025) : "Modèles à copules pour l'inférence de réseaux de régulation multi-omique." Equipe GiBBS; Encadrante : F. JAFFREZIC

VINET Aurélie (10/2020-09/2023) : "Analyse du déterminisme génétique de la tolérance à la chaleur chez les bovins et des interactions génotype x milieu induites." Equipe G2B. Encadrants : D. BOICHARD, B. CUYABANO

XIE Sihan  (12/2023-11/2026) : "L'objectif est de développer un modèle génératif de type GAN pour simuler des données artificielles de génotypes, enrichissant ainsi une base de données (génotypes - phénotypes) en vue de réaliser ultérieurement l'apprentissage d'un modèle de deep learning pour la prédiction des phénotypes." Equipe BIGE. Encadrant : E. BARREY

Date de modification : 02 février 2024 | Date de création : 02 avril 2010 | Rédaction : P. Huan