Mieux comprendre les bases génétiques des émissions de méthane des bovins laitiers

Dans un contexte de lutte contre le réchauffement climatique, les émissions de méthane des ruminants suscitent un intérêt croissant. Bien que des stratégies de réduction par la sélection génétique aient été proposées, les bases génétiques précises des différents phénotypes liés aux émissions de méthane demeurent mal connues.

Menée sur plus de 40 000 vaches Holstein primipares issues d’élevages français, cette étude a combiné six phénotypes d’émissions de méthane prédits à partir de spectres moyen infrarouge (MIR) du lait avec des données de séquence complète imputées. Les caractères étudiés incluent les émissions journalières de méthane (g/j), ainsi que des émissions rapportées à la production de lait corrigée pour les taux protéique et butyreux ou à l’ingestion de matière sèche.
L’analyse a permis d’identifier 57 régions génomiques (QTL) réparties sur 24 des 29 autosomes, certaines communes à plusieurs caractères méthane, témoignant d’une architecture génétique partagée. Plusieurs gènes candidats ont été mis en évidence, notamment FASN, DGAT1, ACSS2 et KCNIP4, impliqués dans des voies biologiques potentiellement liées à la production de méthane. Ces résultats confirment le caractère hautement polygénique de ces caractères et mettent en lumière la complexité de leur base génétique.

Par ailleurs, le chevauchement observé avec des régions déjà associées à des caractères laitiers souligne la difficulté de distinguer les signaux liés à la méthanogenèse de ceux provenant de la prédiction basée sur le lait. Cette étude offre néanmoins de nouvelles perspectives pour la sélection génomique de vaches laitières plus durables, en intégrant les émissions de méthane dans les objectifs de sélection.

Référence 
Fresco S., Sanchez M.P., Boichard D., Fritz S., Martin P. (2025) Sequence-based GWAS reveals genes and variants associated with predicted methane emissions in French dairy cows. Genetics Selection Evolution 57:32. https://doi.org/10.1186/s12711-025-00977-z