Faits marquants en 2021

Etude de l’impact du polymorphisme des microARN sur les caractères laitiers

Contact: Fabienne Le-Provost et Gwenola Tosser-Klopp (GABI/ GenPhySE)
Référence : Bourdon C; LP Fabienne; Tosser, Gwenola ; Mignotte, Bernard ; Arranz Santos, Juan José; Gaspin, Christine ; Dalbiès-Tran, Rozenn ; Leroux, Christine. Recherche d’associations entre microARNs, variants génétiques et QTL laitiers chez les bovins, caprins et ovins [Internet]. 2021. Available from: http://www.theses.fr/2021UPASL020/document

Lancement d’un projet de recherche collaboratif ANR intitulé NANOMILK: «Nanoparticules métalliques polluantes dans le lait: transfert de la mère au petit et rôle des vésicules extracellulaires»

Contact : Anne Burtey
Référence : Burtey, A., Wagner, M., Hodneland, E., Skaftnesmo, K.O., Schoelermann, J., Mondragon, I.R., Espedal, H., Golebiewska, A., Niclou, S.P., Bjerkvig, R., Kögel, T., Gerdes, H.-H., 2015. Intercellular transfer of transferrin receptor by a contact-, Rab8-dependent mechanism involving tunneling nanotubes. The FASEB Journal 29, 4695–4712.

Les relations intrafamiliales complexes des protéines de la famille Prion

Contact : Johan Castille, Bruno Passet 
Référence : Castille J, Passet B, Makhzami S, Vilotte M, Moazami-Goudarzi K, Truchet S, Daniel-Carlier N, Gaillard AL, Andréoletti O, Vaiman D, Beauvallet C, Vaiman A, Floriot S, Calvel P, Mouillet-Richard S, Duchesne A, Béringue V, Vilotte JL. Co-invalidation of Prnp and Sprn in FVB/N mice affects reproductive performances and highlight complex biological relationship between PrP and Shadoo. Biochem Biophys Res Commun. 2021 Apr 30;551:1-6. doi: 10.1016/j.bbrc.2021.03.013.

Webinaire IA & Génétique Animale

Contact : Florence JAFFREZIC
Référence : https://webinaire-ia.journees.inrae.fr/ 

Initiation pour un jeune public aux sciences des données … et à la relecture scientifique !

Contact : Andrea Rau
Référence : A. Rau (2021) Cooking Up Knowledge From Big Data Using Data Science. Frontiers for Young Minds, 9:632923. doi: 10.3389/frym.2021.632923

Organisation d’une conférence en ligne « Microgenomics 2021 Webinar series »

Contact : Claudia Bevilacqua
Référence : https://microgenomics.symposium.inrae.fr/ , https://www.youtube.com/watch?v=6LB5Cm9beoE&t=21s  

Labellisation de l’UMT eBIS associant INRAE, IDELE et ALLICE

Contact : Didier Boichard 

Variabilité du chromosome Y chez les bovins

Contact : Aurélien Capitan 
Référence : Escouflaire C, Capitan A. 2021. Analysis of pedigree data and whole-genome sequences in 12 cattle breeds reveals extremely low within-breed Y-chromosome diversity. Anim Genet. 52, 725-729.  https://doi.org/10.1111/age.13104

Quels sont les facteurs qui affectent la durée de la vie productive des bovins laitiers ?

Contact : Vincent Ducrocq 
Référence : Rostellato R, Promp J, Leclerc H, Mattalia S, Friggens NC, Boichard D, Ducrocq V. 2021. Influence of production, reproduction, morphology and health traits on true and functional longevity in French dairy cattle. J Dairy Sci, https://doi.org/104%2010.3168/jds.2020-19974

Mutation responsable du phénotype « Milca » en race Montbéliarde

Contact : Sandrine Floriot, Mekki Boussaha 
Référence : Floriot S, Duchesne D, Grohs C, Hozé C, Deloche MC, Fayolle G, Vilotte JL, Boichard D, Fritz S,  Boussaha M. 2021. A missense mutation in the FZD7 gene is associated with dilution of the red areas of the coat in Montbéliarde cattle. Anim Genet. 52, 351-355. http://dx.doi.org/10.1111/age.13055

Mise en place d’une méthode pour étudier l’efficience alimentaire de manière dynamique tenant compte des changements biologiques continus au cours de la lactation

Contact : Pauline Martin 
Référence : Martin P, Ducrocq V, Gordo DGM and Friggens NC 2021. A new method to estimate residual feed intake in dairy cattle using time series data. Animal 15, 100101. https://doi.org/10.1016/j.animal.2020.100101

Entre impacts positifs et conséquences négatives, les effets complexes de la consanguinité sur la reproduction de la truite arc-en-ciel

Contact : Florence Phocas
Référence : D'Ambrosio, J., Phocas, F., Haffray, P., Bestin, A., Brard-Fudulea, S., Poncet, C., Quillet, E., Dechamp, N., Fraslin, C., Charles, M., Dupont Nivet, M. (2019). Genome-wide estimates of genetic diversity, inbreeding and effective size of experimental and commercial rainbow trout lines undergoing selective breeding. Genetics Selection Evolution, 51 (1).  doi: 10.1186/s12711-019-0468-4

Paul, K., D'Ambrosio, J., Phocas, F. (2021). Temporal and region-specific variations in genome-wide inbreeding effects on female size and reproduction traits of rainbow trout. Evolutionary Applications, special issue original article, doi.org/10.1111/eva.13308

Paul K., D’Ambrosio J., Phocas F. (2020). Effets de la consanguinité et de la dominance sur les caractères de reproduction femelle chez la truite arc-en-ciel. 3èmes Journées Techniques du Sysaaf, web conference, 8-9 decembre 2020 [Communication orale]

Paul K., D’Ambrosio J., Phocas F. (2021). Old and recent inbreeding effects on female size and reproduction traits in a rainbow trout selected line.  6th international symposium on Genomics In Aquaculture, web conference, 5-7 may 2021 [Communication orale]

Paul K., D’Ambrosio J., Phocas F. (2021). Molecular inbreeding and genetic load for female reproduction traits in a rainbow trout selected line. Aquaculture Europe 2020, web conference, 12-15 april 2021 [Communication orale]

Analyse du déterminisme génétique de la concentration en minéraux du lait de vache

Contact : Marie-Pierre Sanchez
Référence : Sanchez M.P., Rocha D., Charles M., Boussaha M., Hozé C., Brochard M., Delacroix-Buchet A., Grosperrin P., Boichard D. Sequence-based GWAS and post-GWAS analyses reveal a key role of SLC37A1 and ANKH genes and gene regulatory regions on bovine milk minerals. Scientific Reports, 11, 7537. https://doi.org/10.1038/s41598-021-87078-1

Impact de la mutation « Blonde d’Aquitaine » de la myostatine sur les caractères bouchers des bovins

Contact : Aurélie Vinet
Référence : Vinet A, Bouyer C, Forestier L, Oulmouden A, Blanquet V, Picard B, Cassar-Malek I, Bonnet M, Rocha D, Renand G. 2021. The Blonde d’Aquitaine T3811>G3811 mutation in the myostatin gene: association with growth, carcass, and muscle phenotypes in veal calves. J Anim Sci. 99, skab039. https://doi.org/10.1093/jas/skab039