Actualités

Période
article

05 octobre 2023

Rédaction : GABI - Edition P. Huan

Entrer dans le multivers : l’utilisation d’analyses multivariées pour la caractérisation individualisée de voies de régulation multi-omiques

Dans un article publié dans la revue Biostatistics, les biostatisticiens de l’unité GABI, en collaboration avec des cancérologues et des génomiciens humains de l’University of Wisconsin-Milwaukee et du Medical College of Wisconsin, ont proposé une nouvelle approche intégrative pour la quantification et caractérisation de dérégulation des voies de régulation multi-omiques, en calculant des scores individualisés de dérégulation.
UMR 1313 GABI - Génétique Animale et Biologie Intégrative
article

14 septembre 2023

Rédaction : M-P. Sanchez - Edition P. Huan

Une publication de l’équipe G2B sélectionnée en « Editor’s Choice » par le rédacteur en chef de JDS

La publication "Opportunities for genomic selection of cheese-making traits in Montbéliarde cows" paru dans le numéro de juin du Journal of Dairy Science a été sélectionné comme "Editor's Choice" par le rédacteur en chef, Paul Kononoff. Elle sera mise en évidence sur la page d'accueil du journal durant un mois et rejoindra la collection "Choix de la rédaction".
@INRAE - Sandrine Floriot (Impact de la troncation de la protéine C-Nap1 Bovin vs Murin)
article

05 octobre 2023

Rédaction : GABI S. Floriot - Edition P. Huan

C-Nap1, du bovin à la souris, une protéine centriolaire qui dévoile petit à petit ses secrets.

L’étude du syndrome d’Hypoplasie Généralisée (SHGC) en race Montbéliarde a mis en évidence une mutation entrainant la troncation de la protéine C-Nap1. Afin d’approfondir les connaissances sur le rôle de cette protéine, nous avons entrepris la création d’un modèle murin portant une mutation similaire L’analyse de ces souris n’a pas confirmé le rôle de cette protéine dans l’apparition du syndrome SHGC mais révélé son rôle dans la fertilité mâle.
Pixabay
article

05 octobre 2023

Rédaction : INRAE - Edition P. Huan

Découverte d’indicateurs de résilience héritables chez les poules pondeuses

Dans un contexte de changement climatique et de diversification des modes d’élevage, les animaux seront davantage exposés à des perturbations de leur environnement. Afin d’identifier des indicateurs de la résilience des animaux à de telles perturbations, INRAE, l’université de Wageningen (Pays-Bas) et l’entreprise de sélection Hendrix Genetics (Belgique) ont analysé les données de ponte de plus de 60 000 poules pondeuses. Ils en ont déduit trois indicateurs de résilience facilement mesurables et en partie déterminés par des facteurs génétiques. Ces résultats, publiés le 20 avril dans Genetics Selection Evolution, ouvrent de nouvelles perspectives pour la sélection de poules pondeuses plus résilientes.
INRAE F. Mollandin
article

05 octobre 2023

Rédaction : GABI - Edition P. Huan

Rencontre avec Fanny Mollandin, doctorante à GABI

Fanny nous présente son sujet de doctorant qui porte sur les génomes fonctionnels des porcs et des poulets pour améliorer la durabilité et les conditions sanitaires dans la production animale. Un projet financé par le projet H2020 GENE-SWitCH et le département INRAE Génétique Animale.
INRAE @Sophie Pollet
article

05 octobre 2023

Rédaction : INRA GABI - Edition P. Huan

Un nouveau test moléculaire de génotypage pour la sélection des reproducteurs de poneys de sport

Les chercheurs de l’équipe « Biologie Intégrative et Génétique Equine » (BIGE) ont mis au point un test de génotypage de 3 SNP qui expliquent, en partie, la variance de la taille au garrot dans la population des poneys français de selle. Ce nouveau test moléculaire de génotypage permettra d’optimiser la sélection des reproducteurs et la gestion des accouplements raisonnés.
@INRAE D. Boichard
article

05 octobre 2023

Rédaction : GABI D. Boichard - Edition P. Huan

Publication des index bovins laitiers estimés par la méthode "Single Step"

Le Single Step est une méthode d’évaluation génomique qui prend en compte simultanément tous les animaux, génotypés ou non, en une seule étape. C’est une évolution majeure pour la sélection génomique. Ce travail considérable a été conduit en trois étapes : un logiciel entièrement nouveau (HSSGBLUP) développé par INRAE ; des travaux de validation et de comparaison réalisés par l’UMT eBIS (projet ASAP) ; et les travaux de déploiement dans le cadre du projet UNIGENO piloté par GenEval et Idele.
article

14 septembre 2023

Rédaction : INRAE - Edition P. Huan

Concours INRAE 2022 : GABI recrute un-e Chargé-e de recherche en apprentissage statistique et intelligence artificielle

Vous êtes titulaire d’un doctorat (ou équivalent) en Biostatistique / Mathématiques Appliquées / Intelligence Artificielle, avec une excellente formation en apprentissage statistique et science des données. Vous avez un fort intérêt pour la modélisation de données biologiques, et de très bonnes compétences en programmation (langages R/Python) : Postulez pour devenir chercheur ou chercheuse !
@ http://agriculture.gouv.fr
article

05 octobre 2023

Rédaction : GABI - Edition P. Huan

Quelle contribution de la sélection génétique pour l’adaptation de l’agriculture au changement climatique ?

Adapter et protéger l’agriculture face aux défis climatiques est cette réflexion collective portée par le Ministère de l’Agriculture et de l’Alimentation dans le cadre du Varenne agricole de l’eau et de l’adaptation au changement climatique. Retrouvez tous les travaux et conclusions des groupes de travail ainsi que la contribution de la génétique animale pour améliorer la résilience des animaux face au changement climatique !
UMR 1313 GABI - Génétique Animale et Biologie Intégrative
article

14 septembre 2023

Rédaction : GABI - Edition P. Huan

La microdissection laser permet une analyse fine in situ de l’interaction entre des bactéries extracellulaires et l’hôte

La microdissection laser : un outil pour analyser l’expression in situ des gènes de l'entérobactérie Bacillus cereus lors de la colonisation intestinale de l’hôte Galleria mellonella.
article

14 septembre 2023

Rédaction : GABI - Edition P. Huan

En route pour 2022 !

L'UMR GABI vous souhaite une année 2022, belle et légère. Happy new year !
@UMT eBIS
article

05 octobre 2023

Rédaction : GABI - Edition P. Huan

L’UMT eBIS a été labellisée par le Ministère de l’Agriculture avec un projet renouvelé

L’UMT eBIS de nouveau labellisée en 2021 rassemble INRAE, IDELE et ALLICE dans un projet de 5 ans pour produire des connaissances dans le domaine de la caractérisation du génome bovin et du déterminisme génétique des caractères et pour développer des méthodes et outils pour la sélection dans cette espèce. Cette UMT est hébergée dans l’unité GABI à Jouy-en-Josas.
University of South Bohemia. Marc Vandeputte is the second one from the left.
article

05 octobre 2023

Rédaction : M. Vandeputte - Edition P. Huan

Marc Vandeputte, Docteur honoris causa de l’Université de Bohème du Sud

Le 26 novembre dernier, Marc Vandeputte (GABI, équipe Génétique et Aquaculture) a été nommé Docteur honoris causa de l’Université de Bohème du Sud en République Tchèque. Johann Verreth (Professeur émérite à l’Université de Wageningen) a reçu la même distinction ce même jour.
@Pixabay
article

05 octobre 2023

Rédaction : INRAE - Edition P. Huan

Les virus de bactéries : nos fidèles alliés contre l’antibiorésistance

Les virus sont parfois nos ennemis, mais parfois aussi nos amis. Dans la lutte contre les bactéries pathogènes, ils peuvent être des alliés précieux, pour éliminer ces bactéries quand nos médicaments ne fonctionnent plus. Mais plus important encore, ils ne sont pas sources de nouvelles résistances aux antibiotiques chez les bactéries. C’est la conclusion d’une étude menée par INRAE, parue le 25 octobre 2021 dans la revue ISME Communications.
@INRAE Mathilde Dupont-Nivet (Truites arc-en-ciel)
article

05 octobre 2023

Rédaction : K. Paul & al. - Edition P. Huan

Entre impacts positifs et conséquences négatives, les effets complexes de la consanguinité sur la reproduction de la truite arc-en-ciel

L'amélioration génétique de la truite arc-en-ciel a permis d’accroître notablement l'efficacité de la production trutticole ces trente dernières années. Mais cette sélection a contribué à une augmentation de la consanguinité, mettant en péril le progrès génétique à long terme et l’adaptation des populations aux changements environnementaux. C’est pourquoi des chercheurs de l’unité GABI ont cherché à évaluer les effets de la consanguinité sur les performances de reproduction de la truite arc-en-ciel.
 @Groupe FROGS
article

05 octobre 2023

Rédaction : INRAE - Edition P. Huan

FROGS : une grenouille à l’assaut des champignons

Les écosystèmes microbiens (microbiote intestinal, alimentaire, des sols, ...) sont de plus en plus reconnus pour leur rôle majeur dans une multitude de domaines ; parmi eux, les champignons s’invitent fréquemment dans les débats scientifiques. La nouvelle version de la suite logicielle FROGS permet d’identifier précisément les communautés fongiques présentes au sein des microbiotes, en plus des communautés bactériennes, que permettait la version précédente.
@INRAE
article

05 octobre 2023

Rédaction : INRAE - Edition P. Huan

De la vache au peuplier, en passant par l’abeille et le blé, comment se décline la sélection génomique ?

Depuis plus de 10 ans, chez les bovins laitiers, la sélection ‘classique’ a laissé place à la sélection génomique. Cette évolution a permis des progrès plus rapides et une réduction considérable du coût de la sélection. Elle est depuis mise en œuvre dans un nombre croissant d’espèces animales ou végétales et suscite un intérêt très clair pour de nombreuses autres.
@ Tristan Kistler
article

05 octobre 2023

Rédaction : T. Kistler - Edition P. Huan

Polyandrie ou monoandrie ?

Quelles conséquences sur l’évolution génétique d’une population d’abeilles mellifères (Apis mellifera) soumise à sélection ?
UMR 1313 GABI - Génétique Animale et Biologie Intégrative
article

05 octobre 2023

Rédaction : M. Tixier-Boichard, Edition P. Huan

La Journée de lancement du projet H2020 SCALA-MEDI a eu lieu le 7 septembre

Le kick-off du projet H2020 SCALA-MEDI a réuni les 17 partenaires européens pour le lancement de ce projet dont l’objectif est l’Amélioration de la durabilité et de la qualité des productions ovines et avicoles par la mise en valeur du potentiel d'adaptation des races locales dans la zone MEDIterranéenne.
@PixaHive
article

05 octobre 2023

Rédaction : INRAE Service Presse - Edition P. Huan

Microplastiques dans les océans : leur ingestion chronique perturbe la croissance et la reproduction des poissons

INRAE, l’Ifremer, et les universités de Bordeaux et d'Orebrö (Suède) ont étudié la toxicité chronique des microplastiques sur les fonctions biologiques essentielles des poissons. Deux espèces de poissons, l’une marine et l’autre d’eau douce, ont été exposées à différents types de microplastiques, seuls ou enrobés de polluants organiques, pendant 4 mois. Publiés dans la revue Journal of Hazardous Materials du 5 août 2021, les résultats mettent en évidence des défauts de croissance et de reproduction lors d’une exposition à long terme. L'intensité des effets observés varie par ailleurs en fonction de plusieurs variables : type de microparticule, présence ou non de polluants organiques, durée d'exposition.
UMR 1313 GABI - Génétique Animale et Biologie Intégrative
article

14 septembre 2023

Rédaction : GABI - Edition P. Huan

Des liens entre la composition du microbiote fécal et la réponse à la vaccination contre la grippe chez le porc

Une étude conduite par l’équipe Génétique, Microbiote, Santé de l’unité GABI met en évidence qu’il existe, chez le porc, des liens entre la composition du microbiote intestinal et la réponse immunitaire à un vaccin dirigé contre le virus de la grippe porcine (influenza A virus, IAV)). Le microbiote intestinal avant vaccination diffère entre forts et faibles répondeurs à la vaccination et contient des informations prédictives de ces niveaux de réponse. Une abondance plus élevée en certains genres bactériens est trouvée associée à une meilleure réponse immunitaire au vaccin.
  • 5 (current)