GENETIQUE ANIMALE et BIOLOGIE INTEGRATIVE

UMR1313 - GABI

INRAE-AgroParisTech

Comprendre et exploiter la variabilité génétique des animaux

Les orientations scientifiques de GABI visent à comprendre et exploiter la variabilité génétique des animaux pour analyser la construction des phénotypes, les interactions avec les écosystèmes microbiens et l’environnement au sens large, dans un contexte de transition agroécologique.

Expertises et compétences disciplinaires

Labo INRAE

Génétique quantitative, moléculaire et des populations ; génomique fonctionnelle ; biostatistique ; bioinformatique ; biologie fondamentale ; expérimentation sur animaux modèles et d’élevage ; transgenèse souris ; immunophénotypage ; étude des microbiomes et de leurs métagénomes ; approches intégratives pour l’étude des données multi-niveaux et multi-échelles.

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10 octobre 2024

Rédaction : INRAE

La science des données au service de la santé des bovins : une méthode innovante révèle 33 anomalies génétiques jusqu’alors invisibles

L'élevage bovin français est confronté à un défi majeur : la gestion de la consanguinité et son corollaire, l'apparition d'anomalies génétiques récessives affectant la santé et la durabilité des troupeaux. Une étude preuve de concept menée par les généticiens d’INRAE, en partenariat avec l’Institut de l’élevage (IDELE), ELIANCE, les 4 écoles vétérinaires françaises (ENVF) et les principaux organismes et entreprises de sélection français, propose une nouvelle approche pour identifier et contrer ces anomalies. Mettant à profit les grandes bases de données générées pour la sélection des bovins, cette méthode appelée HHED (Homozygous Haplotype Enrichment/Depletion) a fait l’objet d’une publication dans Genome Biology. Grâce à l’analyse des données génomiques et des parcours de vie de millions de bovins, la méthode HHED a permis de détecter 33 nouvelles régions du génome associées à une augmentation du risque de mort juvénile et/ou une réduction de la vie productive des femelles homozygotes. Parmi les découvertes majeures, une mutation génétique, à l'origine du syndrome BLIRD, a été identifiée chez la race Holstein. Ce syndrome, non détecté pendant plus de 40 ans, provoque des retards de croissance et affecte l’immunité intestinale. Ces avancées offrent des perspectives prometteuses pour améliorer la santé et la durabilité des élevages bovins.
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20 septembre 2024

Rédaction : INRAE

L'élevage face aux défis du changement climatique

Ce dossier de presse INRAE illustre des avancées et innovations prometteuses pour que les systèmes d’élevage de demain s’adaptent au changement climatique et contribuent à la neutralité carbone en 2050, tout en assurant attractivité et vitalité économique.
La sélection des animaux d’élevage est principalement réalisée à partir de populations dites « de référence » dans lesquelles on connait pour chaque animal l’information génétique contenue dans l’ADN (le génotype), ainsi que de nombreuses mesures de ses caractéristiques (le phénoype). Quantifier l’association entre les données génétiques et phénotypiques au sein des populations de référence permet ensuite de mieux sélectionner les jeunes animaux dont on ne possède que l’information génétique.
Tous les chevaux domestiques vivant sur terre, qu'ils soient champions de courses ou compagnons de club équestre, trouvent leurs origines dans la vallée du Don au sud-ouest de la Russie, mais la chronologie exacte de leur intégration généralisée dans les sociétés humaines divise encore la communauté scientifique. Une étude publiée le 6 juin dans la revue Nature démontre que l’essor des chevaux domestiques n’a commencé qu’il y a 4 200 ans environ. Cette date marque une nouvelle ère dans l'histoire humaine où les chevaux ont révolutionné la vitesse des déplacements et des échanges entre les peuples. Ces recherches ont été coordonnées par une équipe du CNRS et de l’université Toulouse III – Paul Sabatier dirigée par Ludovic Orlando au sein du Centre d’anthropobiologie et de génomique de Toulouse1 et impliquent 133 scientifiques, issus de 113 institutions à travers le monde.
Solène Fresco nous parle de son métier de doctorante en thèse CIFRE au sein de l'UMT eBIS

Nos publications

Membre fondateur de Sciences Animales Paris-Saclay 

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SAPS est un collectif de recherche dédié à la biologie et à la santé animale, en lien étroit avec l’élevage. Les membres de SAPS (INRAE, AgroParisTech, CNRS, ENVA, ANSES) sont ancrés dans l’Université Paris-Saclay, notamment dans les Graduate Schools Biosphera, Life Science and Health, et également dans l’Université Paris-Est Créteil (UPEC) via ses partenariats avec l’ENVA et l’ANSES.https://saps-paris.hub.inrae.fr/

Membre du Carnot France Futur Élevage

FFE

L'unité GABI est composante du Carnot France Futur Élevage: le réseau labellisé Carnot dédié aux filières d’élevage. Le Carnot France Futur Élevage est un réseau de laboratoires de recherche académique et d’instituts techniques agricoles dédié à promouvoir les collaborations de R&D et le transfert d’innovations au sein des filières d’élevage. https://www.francefuturelevage.com/