Actualités

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14 septembre 2023

Rédaction : GABI - Edition P. Huan

GenTORE H2020 : GENomic management Tools to Optimize Resilience and Efficiency.

L'objectif de GenTORE est de développer des outils innovants de sélection et de gestion génomique afin d'optimiser la résilience et l’efficacité des bovins dans des environnements très variés. Ces outils, comprenant des variables génétiques et non génétiques, seront applicables dans toute la chaîne des systèmes de production bovine (laitière, allaitante et mixte). Ils augmenteront ainsi la viabilité économique, environnementale et sociale des chaines de production européennes d’élevage de bovins viande et laitière.
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09 octobre 2023

Rédaction : GABI - Edition P. Huan

BovReg - Identification of functionally active genomic features relevant to phenotypic diversity and plasticity in cattle.

Le projet scientifique porte sur "identifications des caractéristiques génomiques fonctionnellement actives pertinentes pour la diversité phénotypique et la plasticité chez les bovins".
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09 octobre 2023

Rédaction : GABI - Edition P. Huan

AquaIMPACT : Genomic and Nutritional Innovations for Genetically Superior Farmed Fish.

AquaIMPACT est un nouveau projet Horizon 2020 coordonné par le Natural Resources Institute Finland (Luke), qui intègre l'élevage et la nutrition des poissons afin d'accroître la compétitivité de l'aquaculture européenne du saumon Atlantique, de la truite arc-en-ciel, de la dorade royale et du bar européen.
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09 octobre 2023

Rédaction : GABI - Edition P. Huan

AQUAEXCEL2020: infrastructures en AQUAculture pour l’EXCELLence dans la Recherche aquacole Européenne

AQUAEXCEL est un projet européen de type Infrastructure financé par la Commission Européenne dans le cadre du programme Horizon 2020. Avec 22 institutions partenaires, ce projet vise à intégrer, à l’échelle européenne, les infrastructures clés dans la recherche aquacole dans le but de promouvoir leur utilisation et leur développement coordonnés.
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09 octobre 2023

Rédaction : Presse INRAE

L’annotation des génomes animaux domestiques made in France

Annoter le génome d’une espèce d’intérêt, c’est établir le rôle des différents éléments de celui-ci. Cette cartographie fonctionnelle permet ensuite de mieux comprendre les liens entre les gènes et les phénotypes (1). Des chercheurs d’INRAE ont lancé le projet pilote français FR-AgENCODE afin d’enrichir l’annotation du génome de quatre espèces animales d’élevage (vache, poule, chèvre et porc). Les résultats de ce travail, parus le 30 décembre 2019 dans BMC Biology, permettent d’améliorer la connaissance du fonctionnement des génomes de ces espèces, et contribuent aux objectifs de l’initiative internationale FAANG (« Functional Annotation of Animal Genomes ») (2).
@European community
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14 septembre 2023

Rédaction : GABI Equipe GeMS - Edition P. Huan

Trois nouveaux projets Européens sur l’annotation des génomes

Depuis son lancement, l’initiative FAANG (Functional Annotation of Animal Genomes) s'est élargie grâce aux activités de recherche entreprises par un nombre croissant de partenaires internationaux. L’INRA s’investit fortement dans cette démarche avec l’implication, en coordination ou en participation, dans trois consortiums Européens : GENE-SWitCH, BovReg et AQUA-FAANG.
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14 septembre 2023

Rédaction : Audrey Hulot

Soutenance de thèse de Audrey Hulot

Audrey Hulot a soutenu sa thèse le jeudi 26 novembre : "Analyse de données -omiques : clustering et inférence de réseaux."
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14 septembre 2023

Rédaction : D. Rocha - Edition P. Huan

Etude de l’expression allèle-spécifique chez les bovins

Des variants génétiques peuvent moduler l’expression des gènes et donc potentiellement altérer des phénotypes.
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14 septembre 2023

Rédaction : F. Le Provost - Edition P. Huan

RumimiR : une base de données répertoriant l’ensemble des microARNs bovins, caprins et ovins.

L’utilisation massive des techniques de séquençage haut-débit pour explorer les génomes a généré une grande quantité de données. De nombreuses publications ont décrit plusieurs centaines de séquences de microARNs. Nous avons créé une nouvelle base de données, RumimiR, contenant une description détaillée des microARNs bovins, caprins et ovins.
@INRAE
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14 septembre 2023

Rédaction : P. Croiseau - Edition P. Huan

Impact de la sélection génomique sur la diversité génétique chez les bovins laitiers

L’arrivée de la sélection génomique dans les grandes races bovines laitières a considérablement modifié les programmes de sélection mais son impact sur la diversité génétique était encore inconnu. Cette étude présente un bilan de l’évolution de la diversité génétique avant et après la mise en place de la sélection génomique dans les races bovines Montbéliarde, Normande et Holstein.
@INRAE
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14 septembre 2023

Rédaction : M. Tixier-Boichard - Edition P. Huan

Y-a-t-il des limites à la sélection : le cas des volailles.

La sélection avicole a conduit à obtenir des phénotypes extrêmes. L’évolution du poulet domestiqué à partir de la poule de jungle conduit à s’interroger sur l’existence de limites.
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14 septembre 2023

Rédaction : GABI Equipe G2B - Edition P. Huan

Microbiote ruminal et méthane entérique de vaches Holstein

Dans le cadre du projet Microficient nous avons étudié l’implication des diverses populations de microorganismes (microbiote) du rumen dans les différences d’émission de méthane entérique de vaches Holstein en production. L’analyse de la structure des populations de bactéries a mis en évidence trois groupes ou ruminotypes.
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14 septembre 2023

Rédaction : A. Rau - Edition P. Huan

Une application Web pour de nouvelles collaborations multidisciplinaires

Les données multi-omiques représentent une occasion passionnante d'étudier en profondeur la variabilité moléculaire et l'interaction entre différents niveaux de complexité biologique, mais leur intégration, leur analyse et leur interprétation représentent un défi multidisciplinaire important. Parallèlement, la création d'interfaces web directement à partir du langage de programmation R open-source est désormais possible, ouvrant la voie à un moyen interactif et convivial de communication des données et des résultats d'analyse.
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14 septembre 2023

Rédaction : F. Phocas - Edition P. Huan

Diversité génétique des lignées françaises de truite arc-en-ciel

La diversité génétique de populations françaises de truite arc-en-ciel, commerciales ou expérimentales, a été étudiée sur la base de l’information moléculaire. Quatre lignées commerciales et deux expérimentales ont été génotypées avec la puce AxionTM Trout Genotyping (38000 SNPs utiles). Les résultats montrent une différentiation modérée entre les lignées.
@INRAE
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14 septembre 2023

Rédaction : M. Vandeputte - Edition P. Huan

Des bars plus efficaces par sélection génétique

Pour soutenir le développement nécessaire de la production aquacole, il est indispensable d’aller vers une production plus efficace, consommant moins d’aliments et produisant moins de rejets.
INRAE Test gène poil frisé race Curly
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14 septembre 2023

Rédaction : E. Barrey - Edition P. Huan

Commercialisation d’un test de génotypage du caractère poil frisé chez le cheval de race Curly

Un nouveau test de génotypage permet de déterminer les reproducteurs qui produiront des poulains de race Curly au poil frisé réputé moins allergène pour les cavalières et cavaliers allergiques.
@ Galactinnov
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14 septembre 2023

Rédaction : C. Cebo - Edition P. Huan

Un 2RI (Réseau de Recherches à l’International) France-Québec impliquant plusieurs équipes de l’unité GABI est en cours de montage.

Son objectif est de promouvoir les échanges entre scientifiques et la mobilité de chercheurs et d’étudiants autour de thèmes forts
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14 septembre 2023

Rédaction : F. Calenge - Edition P. Huan

Visite d'anciens vétérinaires de l'école vétérinaire de Lyon : l'équipe GeMS présente ses travaux sur l'étude du microbiote intestinal chez les animaux d'élevage.

Vendredi 20 septembre, le centre INRA de Jouy-en-Josas a accueilli un groupe d'anciens vétérinaires de l'école vétérinaire de Lyon. Deux scientifiques de l'équipe GeMS, Marion Borey et Fanny Calenge ont présenté leurs travaux de recherche sur les intérêts de l’étude du microbiote intestinal chez les animaux d’élevage
@INRAE
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14 septembre 2023

Rédaction : GABI

Lidia Chavinskaia soutiendra sa thèse, le 16 décembre

Lidia Chavinskaia a effectué une thèse intitulée, « La vache globale : La génétique quantitative dans la globalisation de la sélection bovine ». Sa thèse en sociologie des sciences et des techniques (STS pourScience and Tehnology Studies) a été effectuée au sein du Laboratoire Interdisciplinaire Sciences Innovations Sociétés (UMR LISIS) était co-encadré par Pierre-Benoît Joly (sociologue du LISIS) et Vincent Ducrocq (G2B).
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09 octobre 2023

Rédaction : M. Vandeputte - Edition P. Huan

Le projet européen AQUAEXCEL3.0 sélectionné

Le projet AQUAEXCEL3.0, coordonné par Marc Vandeputte, a été sélectionné par l'Union Européenne pour financement sur la période 2020-2025, dans le cadre du programme H2020 Infrastructures.
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09 octobre 2023

Rédaction : GABI Equipe G2B - Edition P. Huan

Déterminisme génétique de l’aptitude fromagère du lait.

Des équations de prédiction des aptitudes fromagères à partir des spectres Moyen Infra Rouge du lait ont été développées et appliquées à plusieurs millions de spectres en race bovine Montbéliarde. Une analyse génétique montre que les paramètres de coagulation et de rendement sont héritables. Une analyse d’association à l’échelle de la séquence du génome complet a mis en évidence 59 QTL, ainsi qu’un réseau de 736 gènes co-régulés.
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