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Répartition des 159 microARN dont l’abondance varie avec le régime alimentaire selon le protocole de restriction et le compartiment du lait
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24 novembre 2023

Rédaction: GABI

Impact des restrictions alimentaires sur la composition en microARN des différents compartiments du lait bovin

Ces travaux rapportent pour la première fois des modifications du miRNome dans plusieurs compartiments du lait lors de restrictions alimentaires entrainant un déficit énergétique chez la vache et ouvrent ainsi la voie vers l’utilisation des miARNs comme biomarqueurs de cet état chez les vaches laitières.
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17 novembre 2023

Rédaction: INRAE - Edition P. Huan

Création du Consortium Pangenome Bovin

La construction d’une séquence génomique de référence unique par espèce a beaucoup apporté dans l’analyse du génome, de sa diversité et de son fonctionnement. Mais elle donne une représentation incomplète de la diversité des génomes au sein d’une espèce. En permettant la production de fragments de séquence de plus grande longueur, les nouvelles technologies de séquençage vont permettre d’aller plus loin dans la connaissance des génomes de chaque espèce. Des chercheurs INRAE participent au « Consortium Pangénome Bovin », une collaboration internationale d’envergure dont l’objectif est de produire un pangénome, c’est-à-dire un large ensemble de génomes assemblés de haute qualité et connectés entre eux, permettant de décrire toute la diversité génomique de l’espèce. Les objectifs complets du consortium sont décrits dans un article publié dans la revue Genome Biology.
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17 novembre 2023

Rédaction: J. Jourdain - Edition P. Huan

Un article publié par des chercheurs de l'UMR GABI a illustré la couverture de la revue scientifique Genome Research

Publié en avance le 6 juillet, un article coécrit par des chercheurs de l'UMR GABI, d’Eliance, de l'UMR GenPhySE, de Genotoul et de l’Idele sur la détection et la caractérisation de réarrangements interchromosomiques chez des bovins a eu l’honneur d’illustrer la couverture du numéro de la revue scientifique Genome Research dans lequel il a été publié. Les éditeurs du journal ont décidé de retenir la proposition de Jeanlin Jourdain !
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@Pixabay
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05 octobre 2023

Rédaction: INRAE - Edition P. Huan

Recherche équine : INRAE et LABÉO renforcent leur partenariat

Le 13 Juillet, le Laboratoire LABEO Frank Duncombe et INRAE ont signé à Caen un accord cadre de partenariat pour la recherche sur la génétique et la santé chez cheval, et plus généralement sur la santé animale et l’environnement. L’équipe Biologie Integrative et Génétique Equine (UMR GABI, INRAE Jouy) va développer ses projets de recherche dans ce cadre, notamment sur la grippe équine, la sélection génomique et “ le coup de sang”(myopathie) chez le cheval de course. Cette collaboration s’affichera à l’international du 12 au 15 Mai 2024, car les deux laboratoires vont organiser le 14eme International Havemeyer Horse Genome Workshop qui réunira une centaine de scientifiques au château de Caen.
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17 novembre 2023

Rédaction: INRAE - Edition P. Huan

Campagne annuelle de mobilité INRAE : consulter les postes ouverts pour rejoindre l'unité GABI

La campagne annuelle de mobilité et la campagne de « mobilité métiers d’avenir » sont ouvertes. Les candidatures pourront être déposées jusqu’au 11 septembre 2023. La campagne est ouverte à l’ensemble des fonctionnaires et agents en CDI de la Fonction Publique.
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INRAE
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05 octobre 2023

Rédaction: F. Le Provost - Edition P. Huan

Effet de l'inflammation sur les marques épigénétiques et leur persistance au cours des lactations successives

L’objectif de ces travaux récemment publiés a été de documenter la contribution de l’épigénétique à la santé et à la longévité des animaux.
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INRAE M. Dupont-Nivet
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05 octobre 2023

Rédaction: Edition P. Huan

La sélection génétique pourrait aider à réduire la mortalité dans les élevages de truite lors des vagues de chaleur

Dans une étude publiée dans Genetics Selection Evolution, des scientifiques de l’UMR de Génétique Animale et Biologie Intégrative – GABI (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Jouy-en-Josas) ont décrit l’architecture génétique de la résistance à l’hyperthermie aiguë, soit la capacité des poissons à survivre à des températures élevées. Ils ont montré que les variations de performance pour ce caractère sont à 29% d’origine génétique dans une population commerciale française, attestant d’un potentiel important d’amélioration génétique. Les corrélations génétiques de ce caractère avec les principaux caractères de production – croissance, % de gras intramusculaire et rendement de carcasse – sont proches de zéro. La sélection pour la résistance à l'hyperthermie aiguë ne devrait donc pas avoir d'impact sur ces caractères et vice-versa.
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14 septembre 2023

Rédaction: Edition P. Huan

Une bande dessinée pour présenter l' "Utilisation de la semence cryoconservée d'un ancien taureau : un moyen de préserver la diversité génétique d'une race locale ?

Afin de communiquer sur les travaux scientifiques parus dans la revue GSE au plus grand nombre, les auteurs ont décidé de présenter cette étude sous forme d’une bande dessinée en anglais et en français. Ce moyen de communication scientifique innovant pourrait permettre d’atteindre un public plus large et moins familier des concepts abordés dans les articles académiques.
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INRAE - Luc Delaby
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05 octobre 2023

Rédaction: INRAE - Edition P. Huan

Quand les chromosomes des bovins s’emmêlent : détecter les anomalies génétiques pour mieux les prévenir

Chez les bovins, comme chez tous les animaux, le matériel génétique est contenu dans des paires de chromosomes, dont chaque exemplaire est réparti aléatoirement lors de la formation des gamètes (spermatozoïdes ou ovocytes). Au cours de ce processus, il peut arriver que du matériel génétique d’un chromosome se déplace vers un autre n’appartenant pas à la même paire, c’est ce que l’on appelle un réarrangement interchromosomique. La fécondation avec un gamète contenant un ou plusieurs chromosomes réarrangés causera un manque ou un surplus de gènes chez l’embryon et aboutira dans la plupart des cas à sa mort. Pour la première fois, des généticiens d’INRAE, en collaboration avec la société ELIANCE, ont mené une étude de population (sur 5 571 taureaux d’insémination) pour quantifier l’occurrence de ces anomalies, leurs origines et leurs conséquences pour les animaux. Leurs résultats, publiés dans Genome Research, montrent qu’1 taureau sur 450 serait porteur d’un réarrangement interchromosomique, avec des conséquences sur la santé et la fertilité des animaux touchés qui coûteraient à la filière plus d’1 million d’euros par taureau d’insémination porteur. Cette étude se base sur les millions de données de génotypage générées en routine pour l’évaluation génomique des taureaux d’insémination et de leurs descendants. L’approche utilisée est la première étape vers un dépistage généralisé de ces anomalies chromosomiques.
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05 octobre 2023

Rédaction: INRAE - Edition P. Huan

Les gènes du chromosome X influencent les performances des vaches laitières

Chez les bovins, comme chez les autres mammifères, le génome est composé de plusieurs paires de chromosomes homologues ou autosomes (présents en 29 paires chez la vache) et d’une paire de chromosomes sexuels, X et Y. Les femelles possèdent 2 copies du chromosome X, tandis que les mâles ont une copie de chaque chromosome X et Y. Bien qu’il contienne un grand nombre de gènes, le chromosome X est souvent négligé dans les études génomiques car il n’est présent qu’en un seul exemplaire chez les mâles. Une équipe de chercheurs INRAE et de l’entreprise Eliance de l’unité Génétique animale et biologie intégrative (GABI) a évalué le rôle du chromosome X et des gènes qu’il abrite sur des caractères clés pour la durabilité de l’élevage bovin. Leurs travaux, publiés dans la revue BMC Genomics, révèlent l’importance du chromosome X dans le déterminisme génétique des caractères et identifient les gènes probablement responsables de ses effets.
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INRAE B. Nicolas (Manipulation sous hotte aspirante)
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05 octobre 2023

Rédaction: Edition P. Huan

Un nouveau test fonctionnel pour l’analyse des variants d’épissage du gène DGAT1 bovin

Le gène DGAT1 joue un rôle majeur dans le métabolisme des graisses et la synthèse des triacylglycérides.
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UMR 1313 GABI - Génétique Animale et Biologie Intégrative
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14 septembre 2023

Rédaction: INRAE - Edition P. Huan

Une nouvelle piste génétique pour endiguer la propagation de la nodavirose, la maladie la plus répandue dans les élevages de bars en mer

Des équipes de l’Ifremer et d’INRAE viennent de découvrir deux gènes impliqués dans la résistance à la nodavirose, une maladie qui touche le cerveau des bars et cause des pertes importantes dans les élevages de Méditerranée. Suite à cette découverte publiée dans la revue Genetics Selection Evolution, les scientifiques et les professionnels des écloseries françaises de bars, qui fournissent plus de 20 % des bars élevés en Méditerranée (Italie, Grèce, Turquie...), ont démarré un nouveau projet pour sélectionner des bars plus résistants face à cette maladie. Un enjeu de taille pour tendre vers une aquaculture plus durable.
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INRAE, Auteur Nicolas Bertrand (bassin de truites en pisciculture)
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05 octobre 2023

Rédaction: Edition P. Huan

Phénotypage de lignées isogéniques de truite pour élucider les mécanismes de résistance aux infections bactériennes

Dans une étude publiée dans Microbes & Infection, des chercheurs de l’équipe Infection et Immunité des Poissons (unité Virologie et Immunologie Moléculaires - VIM, INRAE/UVSQ/UPSaclay, Jouy-en-Josas), en collaboration avec les unités GABI et IERP de l’INRAE, ont établi un ensemble de phénotypes liés à la pathogenèse grâce à la caractérisation d’une collection de lignées isogéniques de truite à la résistance contrastée. Dans une démarche guidée par le principe des 3R, un suivi individuel par prélèvement sanguin non létal a été appliqué pour la première fois chez la truite pour suivre une infection bactérienne ainsi que la réponse de l’hôte ; cette approche permet à la fois de réduire le nombre de poissons utilisés et d’augmenter la puissance du dispositif expérimental.
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Edition Quae
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14 septembre 2023

Rédaction: INRAE - Edition P. Huan

Le livre « La biodiversité domestique : Vers de nouveaux liens entre élevage, territoires et société » vient de paraître aux Editions Quae.

Cet ouvrage réinterroge la diversité des populations animales utilisées en élevage ainsi que la place des races locales. La question de la diversité des animaux d’élevage est abordée en tenant compte de la pluralité des pratiques humaines pour la gérer, l’utiliser et la valoriser. Elle est aussi appréhendée au travers de ses relations avec le reste du vivant, la biodiversité sauvage notamment, que ce soit la diversité de la faune et de la flore dans les territoires d’élevage ou les pathogènes présents dans les milieux d’élevage.
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14 septembre 2023

Rédaction: INRAE - Edition P. Huan

Offre de thèse "Déterminisme génétique de la réponse vaccinale et de la composition du microbiote caecal chez la poule en élevage plein-air."

Cette thèse contribuera à produire des connaissances qui permettront d’accompagner le changement de pratiques, notamment en termes de gestion intégrée de la santé et du bien-être dans les élevages de volailles plein-air.
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@ INRAE R. Lefebvre
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14 septembre 2023

Rédaction: INRAE - Edition P. Huan

L’index d’état corporel, prédicteur de la mobilisation des réserves au cours de la lactation des vaches Holstein ?

En début de lactation, la production augmente plus vite que l’ingestion rendant le bilan énergétique négatif. La mobilisation des réserves corporelles après vêlage et la phase de récupération ultérieure constituent un processus d’adaptation pour franchir cette étape critique. Mais lorsqu’elle est excessive, la mobilisation des réserves corporelles devient un facteur de risque pour la santé et la reproduction.
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@ Alicia Jacques
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05 octobre 2023

Rédaction: A. Jacques - G. Restoux - Edition P. Huan

Réintroduction de diversité génétique dans les populations à partir de semence congelée : Le cas de l'Abondance, une race bovine locale laitière française

La diversité génétique correspond à la variabilité génétique entre individus d’une même population ou entre populations. Dans le cas des animaux d’élevage, les races sont souvent assimilées aux populations, et la diversité qu’elles contiennent est essentielle pour permettre leur évolution et leur adaptation. Cependant, la sélection consiste à choisir les meilleurs individus et ne permet donc pas de maintenir l’ensemble de la diversité des animaux. Toutefois, il est possible de congeler le sperme de taureaux afin de le conserver et potentiellement de l’utiliser plus tard.
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@INRAE Bertrand Nicolas
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12 avril 2024

Rédaction: GABI

Offre de thèse "La redéfinition des objectifs de sélection : une voie pour améliorer la durabilité de la production truiticole dans un contexte de changement climatique"

La thèse cherche à déterminer s'il est possible de combiner des objectifs économiques et environnementaux dans la sélection de la truite arc-en-ciel, à travers des approches de sélection multi-caractères.
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UMR 1313 GABI - Génétique Animale et Biologie Intégrative
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14 septembre 2023

Rédaction: G. Restoux - Edition P. Huan

Les races locales de poules françaises : une ressource à conserver

Les nombreuses races locales de poules françaises constituent un réservoir important de diversité neutre et adaptative. Elles sont généralement élevées en plein air et associées à un territoire, et donc potentiellement adaptées à une large gamme de conditions environnementales, ce qui peut s’avérer utile pour faire face au réchauffement climatique et opérer la transition agroécologique.
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14 septembre 2023

Rédaction: INRAE - Edition P. Huan

Offre de thèse "Méthodes hologénomiques pour prendre en compte le microbiote de l’hôte dans les évaluations génétiques"

Le projet de thèse contribuera à établir des lignes directrices claires pour la simulation de données hologénomiques réalistes, la construction de matrices de similarité basées sur le microbiote, et la combinaison optimale de données génomiques, microbiotes, et multi-omiques dans une grande variété de scenarios.
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05 octobre 2023

Rédaction: P. Huan

Ekaterina Tomilina, doctorante de MaIAGE et GABI en finale du concours Ma Thèse en 180 Secondes à l’Université Paris-Saclay.

Son projet de thèse s’inscrit dans un projet de recherche aux interfaces des disciplines, puisqu’elle est couplée à une problématique biologique de l’INRAE concernant la fertilité des taureaux. Sa présentation a porté sur les méthodes à copules pour l'inférence de réseaux de régulation multi-omiques.
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