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Article

14 septembre 2023

Rédaction: D. Rocha - Edition P. Huan

Etude de l’expression allèle-spécifique chez les bovins

Des variants génétiques peuvent moduler l’expression des gènes et donc potentiellement altérer des phénotypes.

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14 septembre 2023

Rédaction: F. Le Provost - Edition P. Huan

RumimiR : une base de données répertoriant l’ensemble des microARNs bovins, caprins et ovins.

L’utilisation massive des techniques de séquençage haut-débit pour explorer les génomes a généré une grande quantité de données. De nombreuses publications ont décrit plusieurs centaines de séquences de microARNs. Nous avons créé une nouvelle base de données, RumimiR, contenant une description détaillée des microARNs bovins, caprins et ovins.

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14 septembre 2023

Rédaction: P. Croiseau - Edition P. Huan

Impact de la sélection génomique sur la diversité génétique chez les bovins laitiers

L’arrivée de la sélection génomique dans les grandes races bovines laitières a considérablement modifié les programmes de sélection mais son impact sur la diversité génétique était encore inconnu. Cette étude présente un bilan de l’évolution de la diversité génétique avant et après la mise en place de la sélection génomique dans les races bovines Montbéliarde, Normande et Holstein.

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14 septembre 2023

Rédaction: M. Tixier-Boichard - Edition P. Huan

Y-a-t-il des limites à la sélection : le cas des volailles.

La sélection avicole a conduit à obtenir des phénotypes extrêmes. L’évolution du poulet domestiqué à partir de la poule de jungle conduit à s’interroger sur l’existence de limites.

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14 septembre 2023

Rédaction: GABI Equipe G2B - Edition P. Huan

Microbiote ruminal et méthane entérique de vaches Holstein

Dans le cadre du projet Microficient nous avons étudié l’implication des diverses populations de microorganismes (microbiote) du rumen dans les différences d’émission de méthane entérique de vaches Holstein en production. L’analyse de la structure des populations de bactéries a mis en évidence trois groupes ou ruminotypes.

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14 septembre 2023

Rédaction: A. Rau - Edition P. Huan

Une application Web pour de nouvelles collaborations multidisciplinaires

Les données multi-omiques représentent une occasion passionnante d'étudier en profondeur la variabilité moléculaire et l'interaction entre différents niveaux de complexité biologique, mais leur intégration, leur analyse et leur interprétation représentent un défi multidisciplinaire important. Parallèlement, la création d'interfaces web directement à partir du langage de programmation R open-source est désormais possible, ouvrant la voie à un moyen interactif et convivial de communication des données et des résultats d'analyse.

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14 septembre 2023

Rédaction: F. Phocas - Edition P. Huan

Diversité génétique des lignées françaises de truite arc-en-ciel

La diversité génétique de populations françaises de truite arc-en-ciel, commerciales ou expérimentales, a été étudiée sur la base de l’information moléculaire. Quatre lignées commerciales et deux expérimentales ont été génotypées avec la puce AxionTM Trout Genotyping (38000 SNPs utiles). Les résultats montrent une différentiation modérée entre les lignées.

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14 septembre 2023

Rédaction: M. Vandeputte - Edition P. Huan

Des bars plus efficaces par sélection génétique

Pour soutenir le développement nécessaire de la production aquacole, il est indispensable d’aller vers une production plus efficace, consommant moins d’aliments et produisant moins de rejets.

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14 septembre 2023

Rédaction: E. Barrey - Edition P. Huan

Commercialisation d’un test de génotypage du caractère poil frisé chez le cheval de race Curly

Un nouveau test de génotypage permet de déterminer les reproducteurs qui produiront des poulains de race Curly au poil frisé réputé moins allergène pour les cavalières et cavaliers allergiques.

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14 septembre 2023

Rédaction: C. Cebo - Edition P. Huan

Un 2RI (Réseau de Recherches à l’International) France-Québec impliquant plusieurs équipes de l’unité GABI est en cours de montage.

Son objectif est de promouvoir les échanges entre scientifiques et la mobilité de chercheurs et d’étudiants autour de thèmes forts

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14 septembre 2023

Rédaction: F. Calenge - Edition P. Huan

Visite d'anciens vétérinaires de l'école vétérinaire de Lyon : l'équipe GeMS présente ses travaux sur l'étude du microbiote intestinal chez les animaux d'élevage.

Vendredi 20 septembre, le centre INRA de Jouy-en-Josas a accueilli un groupe d'anciens vétérinaires de l'école vétérinaire de Lyon. Deux scientifiques de l'équipe GeMS, Marion Borey et Fanny Calenge ont présenté leurs travaux de recherche sur les intérêts de l’étude du microbiote intestinal chez les animaux d’élevage

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14 septembre 2023

Rédaction: GABI

Lidia Chavinskaia soutiendra sa thèse, le 16 décembre

Lidia Chavinskaia a effectué une thèse intitulée, « La vache globale : La génétique quantitative dans la globalisation de la sélection bovine ». Sa thèse en sociologie des sciences et des techniques (STS pourScience and Tehnology Studies) a été effectuée au sein du Laboratoire Interdisciplinaire Sciences Innovations Sociétés (UMR LISIS) était co-encadré par Pierre-Benoît Joly (sociologue du LISIS) et Vincent Ducrocq (G2B).

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09 octobre 2023

Rédaction: M. Vandeputte - Edition P. Huan

Le projet européen AQUAEXCEL3.0 sélectionné

Le projet AQUAEXCEL3.0, coordonné par Marc Vandeputte, a été sélectionné par l'Union Européenne pour financement sur la période 2020-2025, dans le cadre du programme H2020 Infrastructures.

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09 octobre 2023

Rédaction: GABI Equipe G2B - Edition P. Huan

Déterminisme génétique de l’aptitude fromagère du lait.

Des équations de prédiction des aptitudes fromagères à partir des spectres Moyen Infra Rouge du lait ont été développées et appliquées à plusieurs millions de spectres en race bovine Montbéliarde. Une analyse génétique montre que les paramètres de coagulation et de rendement sont héritables. Une analyse d’association à l’échelle de la séquence du génome complet a mis en évidence 59 QTL, ainsi qu’un réseau de 736 gènes co-régulés.

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14 septembre 2023

Rédaction: M. Tixier-Boichard - Edition P. Huan

Qu’est-ce que le plumage chocolat chez le poulet domestique ?

Le plumage du poulet présente de nombreuses variations de couleur génétiquement déterminées. Le plumage chocolat se caractérise par une couleur brun-chocolat qui remplace le noir chez les animaux porteurs de la mutation ‘choc’, décrite depuis 1996 comme récessive et liée au sexe. Chez plusieurs mammifères domestiques et chez la caille, des mutations du gène codant pour l’enzyme Tyrosinase Related Protein 1 ont été associées à des couleurs dénommées ‘havane’, ‘roux’ ou ‘brun’.

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05 octobre 2023

Rédaction: Web - Edition P. Huan

L’Unité Expérimentale du Pin (61310 le Pin-au-Haras) accueille les Prairiales le jeudi 13 juin prochain.

Une journée de rencontres entre recherche et éleveurs/professionnels de l’élevage. De nombreux chercheurs de l’INRA (Génétique Animale, PHASE, Santé Animale notamment) y présenteront leurs travaux aux éleveurs.

UMR 1313 GABI - Génétique Animale et Biologie Intégrative

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05 octobre 2023

Rédaction: D. Rocha - Edition P. Huan

Etude de l’expression allèle-spécifique chez les bovins vient de paraître dans Scientific Reports

Les chercheurs ont séquencé les génomes et transcriptomes complets de ces animaux et identifié 5 658 Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) montrant un biais d’expression allèlique dans 13% des gènes exprimés.

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05 octobre 2023

Rédaction: Service presse INRA - Edition P. Huan

Lancement du Laboratoire International Associé (LIA) GIMIC "Genetic IMprovement of Indian Cattle and Buffaloes"

Inra en Inde : un nouveau LIA renforce la collaboration de recherche avec la BAIF pour le développement rural, l’environnement et la sécurité alimentaire;

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05 octobre 2023

Rédaction: GABI Equipe G2B - Edition P. Huan

Création du Laboratoire International Associé GIMIC (Genetic IMprovement of Indian Cattle and buffaloes) entre l’unité GABI et une ONG indienne, la BAIF.

Le Laboratoire International Associé GIMIC est créé en 2018 pour une durée de 5 ans. Il coordonne les activités d’une très grande ONG indienne, la BAIF, et d’un groupe de généticiens et d’enseignants chercheurs d’AgroParisTech, membres de l’unité GABI. GIMIC explorera l’utilisation d’outils modernes tels que la sélection génomique pour l’amélioration génétique des croisés taurins x zébus et des buffles en milieu tropical dans des élevages de très petite taille.

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05 octobre 2023

Rédaction: A. Duchesne - Edition P. Huan

Mutation du gène KIF1C : un test pour le dépistage et l’éradication de l’ataxie progressive en race bovine Charolaise, mais aussi un modèle naturel d’une maladie démyélinisante chez l’homme

L’ataxie progressive est une anomalie neurodégénérative décrite chez les bovins Charolais depuis 1972. Elle porte atteinte au bien-être des animaux atteints et elle est coûteuse pour l’élevage du fait de son expression tardive. La mutation responsable a été identifiée dans le gène KIF1C. Une collaboration avec l’Institut du Cerveau et de la Moelle épinière a permis d’exploiter ce modèle bovin pour avancer dans la compréhension de la physiopathologie de ces anomalies.

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14 septembre 2023

Rédaction: GABI Equipe GIS - Edition P. Huan

Initiative internationale FAANG (Functional Annotation of Animal Genomes)

L’initiative FAANG (Functional Annotation of Animal Genomes) a été lancée formellement au début de l’année 2015. Depuis, l’initiative s'est élargie grâce aux activités de recherche entreprises par un nombre croissant de partenaires internationaux. L’INRA a été, et reste, un des partenaires centraux de ce consortium. FAANG est entré maintenant dans une phase de forte expansion, dans laquelle les efforts d’annotations seront conduits à plus large échelle pour l’étude de plusieurs questions scientifiques, avec le but ultime de déchiffrer les mécanismes fins de régulation du génome pour associer génotype et phénotype et donc pour pouvoir exploiter au mieux la variabilité génétique et épigénétique. Cette revue, invitée par le journal « Annual Review of Animal Biosciences » a eu pour but de faire le point sur les résultats acquis par FAANG et de tracer les futures directions de l’initiative.

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