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@ Galactinnov
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14 septembre 2023

Rédaction: C. Cebo - Edition P. Huan

Un 2RI (Réseau de Recherches à l’International) France-Québec impliquant plusieurs équipes de l’unité GABI est en cours de montage.

Son objectif est de promouvoir les échanges entre scientifiques et la mobilité de chercheurs et d’étudiants autour de thèmes forts
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14 septembre 2023

Rédaction: F. Calenge - Edition P. Huan

Visite d'anciens vétérinaires de l'école vétérinaire de Lyon : l'équipe GeMS présente ses travaux sur l'étude du microbiote intestinal chez les animaux d'élevage.

Vendredi 20 septembre, le centre INRA de Jouy-en-Josas a accueilli un groupe d'anciens vétérinaires de l'école vétérinaire de Lyon. Deux scientifiques de l'équipe GeMS, Marion Borey et Fanny Calenge ont présenté leurs travaux de recherche sur les intérêts de l’étude du microbiote intestinal chez les animaux d’élevage
@INRAE
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14 septembre 2023

Rédaction: GABI

Lidia Chavinskaia soutiendra sa thèse, le 16 décembre

Lidia Chavinskaia a effectué une thèse intitulée, « La vache globale : La génétique quantitative dans la globalisation de la sélection bovine ». Sa thèse en sociologie des sciences et des techniques (STS pourScience and Tehnology Studies) a été effectuée au sein du Laboratoire Interdisciplinaire Sciences Innovations Sociétés (UMR LISIS) était co-encadré par Pierre-Benoît Joly (sociologue du LISIS) et Vincent Ducrocq (G2B).
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09 octobre 2023

Rédaction: M. Vandeputte - Edition P. Huan

Le projet européen AQUAEXCEL3.0 sélectionné

Le projet AQUAEXCEL3.0, coordonné par Marc Vandeputte, a été sélectionné par l'Union Européenne pour financement sur la période 2020-2025, dans le cadre du programme H2020 Infrastructures.
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09 octobre 2023

Rédaction: GABI Equipe G2B - Edition P. Huan

Déterminisme génétique de l’aptitude fromagère du lait.

Des équations de prédiction des aptitudes fromagères à partir des spectres Moyen Infra Rouge du lait ont été développées et appliquées à plusieurs millions de spectres en race bovine Montbéliarde. Une analyse génétique montre que les paramètres de coagulation et de rendement sont héritables. Une analyse d’association à l’échelle de la séquence du génome complet a mis en évidence 59 QTL, ainsi qu’un réseau de 736 gènes co-régulés.
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14 septembre 2023

Rédaction: M. Tixier-Boichard - Edition P. Huan

Qu’est-ce que le plumage chocolat chez le poulet domestique ?

Le plumage du poulet présente de nombreuses variations de couleur génétiquement déterminées. Le plumage chocolat se caractérise par une couleur brun-chocolat qui remplace le noir chez les animaux porteurs de la mutation ‘choc’, décrite depuis 1996 comme récessive et liée au sexe. Chez plusieurs mammifères domestiques et chez la caille, des mutations du gène codant pour l’enzyme Tyrosinase Related Protein 1 ont été associées à des couleurs dénommées ‘havane’, ‘roux’ ou ‘brun’.
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05 octobre 2023

Rédaction: Web - Edition P. Huan

L’Unité Expérimentale du Pin (61310 le Pin-au-Haras) accueille les Prairiales le jeudi 13 juin prochain.

Une journée de rencontres entre recherche et éleveurs/professionnels de l’élevage. De nombreux chercheurs de l’INRA (Génétique Animale, PHASE, Santé Animale notamment) y présenteront leurs travaux aux éleveurs.
UMR 1313 GABI - Génétique Animale et Biologie Intégrative
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05 octobre 2023

Rédaction: D. Rocha - Edition P. Huan

Etude de l’expression allèle-spécifique chez les bovins vient de paraître dans Scientific Reports

Les chercheurs ont séquencé les génomes et transcriptomes complets de ces animaux et identifié 5 658 Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) montrant un biais d’expression allèlique dans 13% des gènes exprimés.
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05 octobre 2023

Rédaction: Service presse INRA - Edition P. Huan

Lancement du Laboratoire International Associé (LIA) GIMIC "Genetic IMprovement of Indian Cattle and Buffaloes"

Inra en Inde : un nouveau LIA renforce la collaboration de recherche avec la BAIF pour le développement rural, l’environnement et la sécurité alimentaire;
INRA, V. Ducroq
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05 octobre 2023

Rédaction: GABI Equipe G2B - Edition P. Huan

Création du Laboratoire International Associé GIMIC (Genetic IMprovement of Indian Cattle and buffaloes) entre l’unité GABI et une ONG indienne, la BAIF.

Le Laboratoire International Associé GIMIC est créé en 2018 pour une durée de 5 ans. Il coordonne les activités d’une très grande ONG indienne, la BAIF, et d’un groupe de généticiens et d’enseignants chercheurs d’AgroParisTech, membres de l’unité GABI. GIMIC explorera l’utilisation d’outils modernes tels que la sélection génomique pour l’amélioration génétique des croisés taurins x zébus et des buffles en milieu tropical dans des élevages de très petite taille.
A. Duchesne, INRA,
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05 octobre 2023

Rédaction: A. Duchesne - Edition P. Huan

Mutation du gène KIF1C : un test pour le dépistage et l’éradication de l’ataxie progressive en race bovine Charolaise, mais aussi un modèle naturel d’une maladie démyélinisante chez l’homme

L’ataxie progressive est une anomalie neurodégénérative décrite chez les bovins Charolais depuis 1972. Elle porte atteinte au bien-être des animaux atteints et elle est coûteuse pour l’élevage du fait de son expression tardive. La mutation responsable a été identifiée dans le gène KIF1C. Une collaboration avec l’Institut du Cerveau et de la Moelle épinière a permis d’exploiter ce modèle bovin pour avancer dans la compréhension de la physiopathologie de ces anomalies.
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14 septembre 2023

Rédaction: GABI Equipe GIS - Edition P. Huan

Initiative internationale FAANG (Functional Annotation of Animal Genomes)

L’initiative FAANG (Functional Annotation of Animal Genomes) a été lancée formellement au début de l’année 2015. Depuis, l’initiative s'est élargie grâce aux activités de recherche entreprises par un nombre croissant de partenaires internationaux. L’INRA a été, et reste, un des partenaires centraux de ce consortium. FAANG est entré maintenant dans une phase de forte expansion, dans laquelle les efforts d’annotations seront conduits à plus large échelle pour l’étude de plusieurs questions scientifiques, avec le but ultime de déchiffrer les mécanismes fins de régulation du génome pour associer génotype et phénotype et donc pour pouvoir exploiter au mieux la variabilité génétique et épigénétique. Cette revue, invitée par le journal « Annual Review of Animal Biosciences » a eu pour but de faire le point sur les résultats acquis par FAANG et de tracer les futures directions de l’initiative.
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05 octobre 2023

Rédaction: GABI Equipe GENAQUA - Edition P. Huan

Aquakultor, le premier jeu vidéo pour smartphone dans lequel le joueur devient pisciculteur.

La production aquacole augmente chaque année et doit faire face aux enjeux de durabilité. C’est dans ce cadre que les travaux de thèse de Mathieu Besson (collaboration Université de Wageningen et INRA, Rennes) ont démontré que la sélection génétique peut à la fois améliorer les retombées économiques des élevages piscicoles et réduire leurs impacts environnementaux.
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05 octobre 2023

Rédaction: GABI Equipe G2B - Edition P. Huan

Déterminisme génétique de la taille des bovins.

Dans le cadre du consortium international "1000 génomes bovins", des chercheurs de l’Inra et d’Allice et leurs collègues étrangers ont exploré le déterminisme génétique de la stature des animaux, mettant en évidence sa complexité. Au moins 163 régions génomiques sont impliquées dans le contrôle génétique de la taille des bovins, mais elles n’expliquent que 14 % de la variabilité de ce caractère dans des populations contrôle. Ce déterminisme génétique complexe de la taille s’apparente à ce qui a été observé chez l’homme pour lequel les gènes mis en évidence n’expliquent que 10 à 20 % de la variabilité observée.
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05 octobre 2023

Rédaction: GABI Equipe G2B - Edition P. Huan

L’INRA acteur de la mise en application du Règlement Zootechnique Européen.

Le Règlement Zootechnique Européen 2016/1012, entré en application au 1er novembre 2018, modifie le cadre de la sélection animale. Cette disposition rend caduque la mission réglementaire de l’INRA en matière de réalisation des évaluations.
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14 septembre 2023

Rédaction: GABI Equipe G2B - Edition P. Huan

Identification de deux mutations responsables de mortalité embryonnaire en race Holstein.

Le développement de la sélection génomique bovine engendre un grand nombre de génotypages. Cette base de données permet de mettre en évidence des haplotypes présentant un déficit important d’homozygotes avec une puissance croissante. Elle permet aussi de tester des mutations candidates mises en évidence après séquençage et avec de bonnes informations d’annotation. Ces deux approches ont permis d’identifier deux mutations létales à l’état homozygote dans les gènes SDE2 et CENPU.
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14 septembre 2023

Rédaction: Y. Ramayo-Caldas, D. Rocha - Edition P. Huan

Signature de sélection chez le bovin Charolais de Cuba

Les bovins charolais importés à Cuba au début du XXème siècle constituent un modèle intéressant pour étudier l’adaptation à la chaleur. Des études de diversité génétique ont mis en évidence 104 régions du génome qui différencient les bovins charolais cubains, dans lesquels ont été identifiés des gènes impliqués dans la résistance aux maladies, aux changements physiologiques et à la tolérance à la chaleur mais également dans le développement musculaire. Ces travaux, conduits par un groupe multidisciplinaire de chercheurs cubains, français et espagnols, fournissent des pistes pour comprendre les processus biologiques liés à l'adaptation des bovins aux conditions tropicales.
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05 octobre 2023

Rédaction: PHuan

Workshop Deep Learning et Génomique : les présentations des orateurs sont disponibles

Cette thématique intéresse particulièrement la communauté scientifique, et ce séminaire a réuni près de deux cents participants d'horizons et de disciplines diverses (médecins, biologistes, bioinformaticiens et statisticiens).
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14 septembre 2023

Rédaction: Consortium PREDICT-Psay-CompBio

Les consortiums PREDICT et Psay-CompBio vous invitent à participer au workshop Deep Learning et Génomique

Avec le développement des données « x-omiques » et les nouvelles techniques de séquençage, la biologie est entrée dans l’ère du « Big Data ». En parallèle, les méthodes liées aux réseaux de neurones ont connu un spectaculaire regain d’intérêt avec le « Deep Learning » appliqué à des données massives.
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14 septembre 2023

Rédaction: Florence Jaffrézic et Denis Laloë (PSGen) - Edition P. Huan

Le workshop PREDICT Psay-CompBio a réuni une centaine de participants.

Plusieurs thèmes ont été abordés en lien avec l’intégration de données hétérogènes et de haute dimension pour la découverte de biomarqueurs prédictifs.
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14 septembre 2023

Rédaction: Service Presse Inra - Edition P. Huan

Les vaches, "top modèles" de la recherche

La vache peut être un modèle pertinent pour l’étude des anomalies génétiques humaines. C’est la conclusion d’une équipe internationale menée par l’Inra - en collaboration avec ALLICE, le CEA et VetAgroSup pour la France - publiée dans la revue Scientific Reports. Chez le bovin, l’étude de mutations responsables de syndromes rares, que l’on rencontre également chez l’Homme, offre une alternative intéressante aux animaux de laboratoire pour confirmer l’origine génétique de ces maladies et déterminer les mécanismes moléculaires sous-jacents.