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UMR 1313 GABI - Génétique Animale et Biologie Intégrative

14 septembre 2023

Rédaction : INRAE - Edition P. Huan

Une nouvelle piste génétique pour endiguer la propagation de la nodavirose, la maladie la plus répandue dans les élevages de bars en mer

Des équipes de l’Ifremer et d’INRAE viennent de découvrir deux gènes impliqués dans la résistance à la nodavirose, une maladie qui touche le cerveau des bars et cause des pertes importantes dans les élevages de Méditerranée. Suite à cette découverte publiée dans la revue Genetics Selection Evolution, les scientifiques et les professionnels des écloseries françaises de bars, qui fournissent plus de 20 % des bars élevés en Méditerranée (Italie, Grèce, Turquie...), ont démarré un nouveau projet pour sélectionner des bars plus résistants face à cette maladie. Un enjeu de taille pour tendre vers une aquaculture plus durable.
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INRAE, Auteur Nicolas Bertrand (bassin de truites en pisciculture)

05 octobre 2023

Rédaction : Edition P. Huan

Phénotypage de lignées isogéniques de truite pour élucider les mécanismes de résistance aux infections bactériennes

Dans une étude publiée dans Microbes & Infection, des chercheurs de l’équipe Infection et Immunité des Poissons (unité Virologie et Immunologie Moléculaires - VIM, INRAE/UVSQ/UPSaclay, Jouy-en-Josas), en collaboration avec les unités GABI et IERP de l’INRAE, ont établi un ensemble de phénotypes liés à la pathogenèse grâce à la caractérisation d’une collection de lignées isogéniques de truite à la résistance contrastée. Dans une démarche guidée par le principe des 3R, un suivi individuel par prélèvement sanguin non létal a été appliqué pour la première fois chez la truite pour suivre une infection bactérienne ainsi que la réponse de l’hôte ; cette approche permet à la fois de réduire le nombre de poissons utilisés et d’augmenter la puissance du dispositif expérimental.
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Edition Quae

14 septembre 2023

Rédaction : INRAE - Edition P. Huan

Le livre « La biodiversité domestique : Vers de nouveaux liens entre élevage, territoires et société » vient de paraître aux Editions Quae.

Cet ouvrage réinterroge la diversité des populations animales utilisées en élevage ainsi que la place des races locales. La question de la diversité des animaux d’élevage est abordée en tenant compte de la pluralité des pratiques humaines pour la gérer, l’utiliser et la valoriser. Elle est aussi appréhendée au travers de ses relations avec le reste du vivant, la biodiversité sauvage notamment, que ce soit la diversité de la faune et de la flore dans les territoires d’élevage ou les pathogènes présents dans les milieux d’élevage.
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14 septembre 2023

Rédaction : INRAE - Edition P. Huan

Offre de thèse "Déterminisme génétique de la réponse vaccinale et de la composition du microbiote caecal chez la poule en élevage plein-air."

Cette thèse contribuera à produire des connaissances qui permettront d’accompagner le changement de pratiques, notamment en termes de gestion intégrée de la santé et du bien-être dans les élevages de volailles plein-air.
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@ INRAE R. Lefebvre

14 septembre 2023

Rédaction : INRAE - Edition P. Huan

L’index d’état corporel, prédicteur de la mobilisation des réserves au cours de la lactation des vaches Holstein ?

En début de lactation, la production augmente plus vite que l’ingestion rendant le bilan énergétique négatif. La mobilisation des réserves corporelles après vêlage et la phase de récupération ultérieure constituent un processus d’adaptation pour franchir cette étape critique. Mais lorsqu’elle est excessive, la mobilisation des réserves corporelles devient un facteur de risque pour la santé et la reproduction.
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@ Alicia Jacques

05 octobre 2023

Rédaction : A. Jacques - G. Restoux - Edition P. Huan

Réintroduction de diversité génétique dans les populations à partir de semence congelée : Le cas de l'Abondance, une race bovine locale laitière française

La diversité génétique correspond à la variabilité génétique entre individus d’une même population ou entre populations. Dans le cas des animaux d’élevage, les races sont souvent assimilées aux populations, et la diversité qu’elles contiennent est essentielle pour permettre leur évolution et leur adaptation. Cependant, la sélection consiste à choisir les meilleurs individus et ne permet donc pas de maintenir l’ensemble de la diversité des animaux. Toutefois, il est possible de congeler le sperme de taureaux afin de le conserver et potentiellement de l’utiliser plus tard.
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@R.Ciampolini: Vaches Maremmana

23 juillet 2024

Rédaction : GABI

Offre de thèse "Apports de la génomique pour la transition agro-écologique : Une approche multi-espèce et multi-contexte"

Cette thèse propose de démontrer l’utilité de ces outils afin de mobiliser la diversité génétique dans une optique de transition agroécologique.
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UMR 1313 GABI - Génétique Animale et Biologie Intégrative

14 septembre 2023

Rédaction : G. Restoux - Edition P. Huan

Les races locales de poules françaises : une ressource à conserver

Les nombreuses races locales de poules françaises constituent un réservoir important de diversité neutre et adaptative. Elles sont généralement élevées en plein air et associées à un territoire, et donc potentiellement adaptées à une large gamme de conditions environnementales, ce qui peut s’avérer utile pour faire face au réchauffement climatique et opérer la transition agroécologique.
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14 septembre 2023

Rédaction : INRAE - Edition P. Huan

Offre de thèse "Méthodes hologénomiques pour prendre en compte le microbiote de l’hôte dans les évaluations génétiques"

Le projet de thèse contribuera à établir des lignes directrices claires pour la simulation de données hologénomiques réalistes, la construction de matrices de similarité basées sur le microbiote, et la combinaison optimale de données génomiques, microbiotes, et multi-omiques dans une grande variété de scenarios.
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05 octobre 2023

Rédaction : P. Huan

Ekaterina Tomilina, doctorante de MaIAGE et GABI en finale du concours Ma Thèse en 180 Secondes à l’Université Paris-Saclay.

Son projet de thèse s’inscrit dans un projet de recherche aux interfaces des disciplines, puisqu’elle est couplée à une problématique biologique de l’INRAE concernant la fertilité des taureaux. Sa présentation a porté sur les méthodes à copules pour l'inférence de réseaux de régulation multi-omiques.
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14 septembre 2023

Rédaction : INRAE - Edition P. Huan

Offre de thèse "Décrypter les variations phénotypiques des trois espèces de ruminants et comprendre leur évolution à l’aide de pangénomes."

Le projet de thèse proposé permet d’établir une nouvelle structuration des données génomiques sous la forme d'un graphe de pangénome. Il permet la compression sans perte de l'information de plusieurs centaines de génomes tout en préservant l'organisation chromosomique des gènes bovins, ovins et caprins. Ce nouveau type de ressources a prouvé son utilité chez la tomate pour améliorer la puissance de détection des variants génétiques à l’origine des variations phénotypiques d’intérêt agronomique.
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INRAE

05 octobre 2023

Rédaction : GABI M. Tixier-Boichard - Edition P. Huan

Un nouveau consortium sur la diversité génomique des poulets : La génomique à grande échelle pour déchiffrer les origines et les adaptations des poulets

Le projet FarmGenomic a pour l'objectif d'explorer « Comment l'ère de la génomique à haut débit peut être exploitée pour répondre aux questions évolutives concernant le poulet ? ».
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05 octobre 2023

Rédaction : GABI - Edition P. Huan

Elitsa Ivanova soutiendra sa thèse, le mardi 14 mars (14h) dans l’amphithéâtre Jacques Poly (bât. 440) au centre INRAE de Jouy-en-Josas.

Son travail de thèse intitulé "La glande mammaire : Rôle de SOCS2 dans son développement et impact d’une inflammation lors de lactations successives" a été réalisé sous la direction de Fabienne Le Provost au sein de l’unité GABI.
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INRAE

05 octobre 2023

Rédaction : INRAE - Edition P. Huan

Concours externes Ingénieurs et techniciens INRAE 2023 : inscriptions jusqu'au 23 mars

Plus de 250 postes sont à pourvoir maintenant sur le site INRAE Jobs ! Découvrez tous les profils de poste offerts et inscrivez-vous en ligne. Si vous n'avez pas le diplôme requis pour postuler, pensez à demander une demande d'équivalence. Découvrez les profils de poste ouverts pour rejoindre les équipes de l'untié GABI !
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03 février 2023

Rédaction : INRAE - Edition P. Huan

Concours chercheur-se INRAE 2023 : GABI recrute deux Chargé-e de recherche.

Vous avez envie de contribuer à la recherche publique, de vous investir dans des projets porteurs d'enjeux pour la société ? Alors rejoignez nos équipes de recherche en vous inscrivant aux concours de chargés de recherche (H/F) : inscriptions jusqu'au 2 mars 2023.
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14 septembre 2023

Rédaction : INRAE

GABI vous souhaite une belle année 2023

Notre futur s'écrit maintenant !
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14 septembre 2023

Rédaction : Communication GABI - P. Huan

Offre d'emploi pour le projet d'infrastructure européen EuroFAANG

Vous souhaitez rejoindre l'INRAE à GABI et profiter de la vie en France ? Envoyez votre candidature pour rejoindre l'équipe internationale et dynamique d'EuroFAANG ! EuroFAANG est un projet d'infrastructure européen (HORIZON-INFRA-2022-DEV-01 Research Infrastructure Concept Development) coordonné par l'Institut de recherche en biologie des animaux d'élevage (FBN, Allemagne) qui débutera en janvier 2023 et se terminera en décembre 2025. Nous recherchons un(e) assistant(e) gestionnaire de recherche dynamique et motivé(e).
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INRAE

05 octobre 2023

Rédaction : F. Phocas - Edition P. Huan

Étude d'association pangénomique et prédiction génomique de la tolérance à l'hypoxie aiguë chez la truite arc-en-ciel

Les poissons sont exposés à de grandes variations de concentration de l'oxygène dans leur environnement aquatique. Quand celui-ci est appauvri en oxygène par rapport au besoin pour maintenir le bon métabolisme énergétique des poissons, on parle d’hypoxie. L'hypoxie est l'une des principales menaces pour le secteur de l'aquaculture, entraînant des pertes économiques substantielles pour les pisciculteurs. Elle peut affecter fortement la santé et le bien-être des poissons, en impactant la croissance, la reproduction, le comportement, l'immunité et les autres activités exigeantes en énergie. Ainsi, l’amélioration de la tolérance à l'hypoxie est d'un grand intérêt tant économique qu’éthique à être incluse dans les programmes de sélection aquacole.
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INRAE. Marie-Christine Lhopital, Race bovine limousine au coeur des Monts du Lyonnais (Sourcieux les Mines, Rhone)

05 octobre 2023

Rédaction : GABI - Edition P. Huan

Le gène MYH3, codant pour une myosine embryonnaire, est muté dans une forme récessive de palais fendu chez les bovins Limousins

Parmi les anomalies remontées à l’Observatoire National des Anomalies Bovines (ONAB, www.onab.fr), une forme de palais fendu a émergé en 2012 chez les bovins de race Limousine. Les animaux présentent une fente palatine totale touchant le palais osseux et le palais musculaire. Dans la majorité des cas, aucun autre signe clinique n’est associé à la fente palatine. Néanmoins, la survie des animaux et leur bien-être sont largement compromis par cette anomalie.
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CC Pikist

05 octobre 2023

Rédaction : GABI - Edition P. Huan

Une stratégie thérapeutique prometteuse pour la COVID—19 : la technologie des oligonucléotides antisens.

La pandémie actuelle de COVID-19 continue de nécessiter de nouvelles stratégies thérapeutiques efficaces. Nous avons exploré la thérapie antisens utilisant des oligonucléotides ciblant le génome du coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2). Nous avons le plaisir d’annoncer la publication de ce travail collaboratif GABI-VIM-Univ Andres Bello (Santiago, Chili) sur la démonstration expérimentale de l'activité d'Oligonucléotides Antisens actifs pour inhiber in vitro la réplication du virus SARS-CoV-2, responsable de la COVID-19.
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INRAE

14 septembre 2023

Rédaction : UMR GABI M-P. Sanchez - Edition P. Huan

Vers une amélioration de la résistance à la paratuberculose bovine en race Holstein grâce à une évaluation génomique Single-Step

La paratuberculose bovine est une maladie contagieuse, incurable et difficile à contrôler, causée par Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis (MAP). Elle a des effets néfastes sur le bien-être des animaux et des conséquences économiques importantes. Des premiers travaux, réalisés sur plus de 1600 vaches Holstein et 900 vaches Normande avec des statuts confirmés et des génotypes (projets PICSAR/PARADIGM), ont mis en évidence des régions du génome impliquées dans la résistance à cette maladie. Ces résultats ont encouragé une remontée massive des dosages sérologiques (ELISA), réalisés sur du sang de vaches issues d’élevages du grand Ouest engagés dans un plan de lutte contre MAP.
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